分子可视化程序已成为包括计算化学和结构生物学在内的许多科学领域中极其有价值的工具。它们使我们能够可视化和分析蛋白质、核酸和有机小分子等分子的结构，达到实验室无法达到的详细程度和定制化程度。
截至今天，使用计算机可以从专用网站（例如，蛋白质数据库 (PDB)）下载数以千计的蛋白质结构，并使用程序可视化它们、旋转它们的结构、放大感兴趣的原子、计算距离、只需几个简单的步骤即可完成所有操作。
这些工具可以帮助我们了解分子结构和功能之间的关系，并可用于设计和优化药物、研究蛋白质-配体相互作用，以及通常检索蛋白质及其主要结构特征的视觉表示。
使用分子可视化软件的一些好处包括提高我们对分子 3D 结构的理解的一般能力，从而识别对系统功能至关重要的结构特征。另一个重点是可以观察通过分子动力学 (MD) 模拟获得的系统的动态演化。最后，它们可用于为您的出版物或演示文稿生成高质量的图像和电影。
在本教程中，我将介绍 PyMOL 的基础知识，这是最著名的分子可视化软件之一，以便您可以体验其一般功能。
布局主要由三个部分组成
——顾名思义，显示区域是将分子加载到 PyMOL 后显示和操作分子的地方。默认情况下，您可以通过使用鼠标（分别为左键、右键、滚轮）或触控板（左键、右键、Ctrl + 单击）拖动来旋转、缩放和平移。
用于渲染和动画 3D 结构的综合软件包
发布亮点
统一的现代用户界面
PyQt 界面取代了所有平台上的 Tcl/Tk 和 MacPyMOL
Anaconda Python 发行版
更好的第三方插件和自定义脚本支持
开放获取激励可执行文件
自由评估政策
Release Highlights
Unified modern user interface
PyQt interface replaces Tcl/Tk and MacPyMOL on all platforms
Anaconda Python distribution
Better third-party plugin and custom scripting support
Open access incentive executables
Liberal evaluation policy
System Requirements
OS:64-bit Linux, including CentOS 7+, Ubuntu 18.04+, and others (glibc 2.12+)
CPU:x86_64 compatible processor
Memory:4 GB memory per core
Space:18 GB disk space for software installation; 400-500 GB if databases (PDB, BLAST, etc) are also installed
Network card with a configured network interface
16-bit color (for Maestro)
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